Genetic response to lung infection: on the quest for distinctive expression signatures

    Project Details

    Description

    Luftvejsinfektioner forårsager kolossale økonomiske tab for danske og udenlandske svineproducenter. Vi vil undersøge grisens gen-aktivitet som den udspiller sig under forskellige lunge infektioner. Det vil blive undersøgt om man ved hjælp af en enkelt blodprøve eller i indsendt lungevæv kan identificere hvilke(n) mikroorganismer der ligger til grund for lungeinfektionen og derved målrette den videre behandling.

    Det vil vi gøre i projektet ved at undersøge hvilke forandringer der opstår i grisens gen-aktivitet under lungeinfektioner forårsaget af bakterier og virus. For at belyse hvilke gener der bliver op- og nedreguleret bruges allerede etableret microarray teknologi. Ved hjælp af denne teknik kan vi måle aktiviteten af flere tusinde gener på samme tid og derved opnå et fingeraftryk med meget høj opløsning. Vi vil fokusere på de ændringer i gen-aktivitet, der foregår tidligt efter at en infektion har etableret sig.

    For at nedbringe dyreforsøg til et absolut minimum vil vi tage udgangspunkt i et betydeligt antal formalin-fikserede vævssnit fra tidligere velkarakteriserede infektionsforløb ved Veterinærinstituttet. Det er inden for de sidste par år blevet muligt at foretage analyser for genaktivitet på sådanne vævssnit på grund af nye og bedre metoder til oprensning af RNA.

    Følgende publikationer er pt. udarbejdet som en del af dette projekt:

    Shila Mortensen, Kerstin Skovgaard, Jakob Hedegaard, Christian Bendixen and Peter M.H.
    Heegaard. 2009. Transcriptional profiling at different sites in lungs of pigs during acute bacterial respiratory infection. Accepted for publication. Innate Immun.

    Kerstin Skovgaard, Shila Mortensen, Mette Boye, Jakob Hedegaard, Peter M. H. Heegaard. 2009. Hepatic gene expression changes in pigs experimentally infected with the lung pathogen Actinobacillus pleuropneumoniae as analysed with an innate immunity focused microarray. Innate Immun. 2009 Aug 26. [Epub ahead of print]. Joint first authors.

    K. Skovgaard, S. Mortensen, M. Boye, K.T. Poulsen, F.M. Campbell, P.D. Eckersall, P.M.H. Heegaard, 2009. Rapid and widely disseminated acute phase protein response after experimental bacterial infection of pigs. Veterinary Research 40(3):23. Epub 2009 Feb 24.
    StatusFinished
    Effective start/end date01/01/200831/12/2010