Kerstin Skovgaard forsker i immunologiske processer under infektioner. Det gøres ved at undersøge hvordan og i hvilken grad forskellige geners aktivitet bliver op- og nedreguleret i en inficeret værts forskellige væv kort tid efter at en infektion har etableret sig. Konkret undersøger vi, hvordan kvæg og grise reagerer på forskellige typer af normalt forekommende infektioner, og gen-aktiviteten måles, som den udspiller sig under en infektion, ved at undersøge hvor store mængder messenger-RNA, der findes i cellerne til et givent tidspunkt. Senest har vi kortlagt sådanne responser fra dyr efter infektion med Actinobacillus pleuropneumoniae, som forårsager ondartet lungesyge hos svin og i cellekulturer isoleret fra kvæg med paratuberculose. Ved hjælp teknikker som microarray (DNA-chip) og real time PCR-analyser kan vi måle aktiviteten af flere tusinde gener på samme tid og dermed få et nuanceret billede af de immunologiske processer, der foregår under en infektion.